1月26日，省部共建豬遺傳改良與養(yǎng)殖技術(shù)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室撰寫的“全基因組重測序揭示豬環(huán)境適應(yīng)性的分子機(jī)理及可能的屬間雜交現(xiàn)象”論文，在國際上首次采用新一代測序技術(shù)，對豬開展了深度（25X）基因組重測序分析，全文在線發(fā)表于國際頂級學(xué)術(shù)期刊《自然-遺傳》，這是我國豬遺傳育種領(lǐng)域第2篇發(fā)表于該刊物的論文，也是江西省發(fā)表于影響因子最高的國際頂級學(xué)術(shù)期刊的論文，實(shí)現(xiàn)了我國動物遺傳育種基礎(chǔ)研究領(lǐng)域重要原創(chuàng)性科技成果的新突破。

　　該項(xiàng)基礎(chǔ)科學(xué)研究成果——全基因組重測序揭示豬環(huán)境適應(yīng)性的分子機(jī)理及可能的屬間雜交現(xiàn)象（Adaptation and possible ancient interspecies introgression in pigs identified by whole-genome sequencing），是由依托江西農(nóng)業(yè)大學(xué)的省部共建豬遺傳改良與養(yǎng)殖技術(shù)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室為主導(dǎo)，在國家重大科技專項(xiàng)、國家自然科學(xué)基金重點(diǎn)項(xiàng)目和教育部長江學(xué)者創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)項(xiàng)目的資助下，聯(lián)合深圳華大基因科技服務(wù)有限公司共同完成的。江西農(nóng)業(yè)大學(xué)是該論文的唯一通訊作者單位，黃路生院士和任軍教授為論文的共同通訊作者，江西農(nóng)業(yè)大學(xué)艾華水博士、楊斌博士和深圳華大科技的方曉東博士為論文的共同第一作者?！蹲匀?遺傳》（Nature Genetics）創(chuàng)刊于1993年，是國際遺傳學(xué)研究領(lǐng)域的頂級學(xué)術(shù)刊物，影響因子29.65，在全球11000余種SCI期刊中排名第22位。

　　我國是世界第一養(yǎng)豬生產(chǎn)大國，2014年生豬出欄7.35億頭，占全球總量的一半。中國也是全球家豬的兩個主要馴化中心之一，擁有全球最豐富的地方豬種資源，品種數(shù)量占全球總量的1/3。經(jīng)過近萬年的自然選擇和人工選育，中國地方豬種形成了繁殖力高、肉質(zhì)鮮美、抗逆性強(qiáng)等優(yōu)異種質(zhì)特性，并對中國南北方不同的生態(tài)環(huán)境產(chǎn)生了極佳的適應(yīng)性。然而，導(dǎo)致這種環(huán)境適應(yīng)性的分子機(jī)理并不為人所知。

　　省部共建豬遺傳改良與養(yǎng)殖技術(shù)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室歷時4年半，成功構(gòu)建了覆蓋我國24個省市自治區(qū)現(xiàn)有68個豬種的中國地方豬種基因組DNA庫。在此基礎(chǔ)上，優(yōu)選出來自我國15個不同地理居群的、代表廣泛血緣的12個豬種69頭無相關(guān)血緣中國地方豬；與深圳華大基因科技服務(wù)有限公司的研究人員一起，針對這69頭豬進(jìn)行了全基因組高覆蓋度（25X）的重測序，由此鑒別了4100萬個基因組變異位點(diǎn)，其中2100萬為新發(fā)現(xiàn)的位點(diǎn)，占52%, 極大地豐富了國際豬基因組遺傳變異位點(diǎn)數(shù)據(jù)庫，為全球特別是中國地方豬種質(zhì)特性遺傳機(jī)制研究和優(yōu)良基因資源挖掘提供了重要基礎(chǔ)性科學(xué)數(shù)據(jù)。利用這些數(shù)據(jù)與公共數(shù)據(jù)庫中的歐洲豬種基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行比較，發(fā)現(xiàn)中歐豬種之間存在廣泛的基因交流，證實(shí)了中國地方豬對全球現(xiàn)代商業(yè)豬種的培育作出過重要貢獻(xiàn)。研究人員進(jìn)一步采用群體基因組學(xué)研究策略，在全基因組范圍內(nèi)系統(tǒng)鑒別了與不同緯度環(huán)境適應(yīng)性有關(guān)的219個基因位點(diǎn)，這些位點(diǎn)與毛發(fā)生長、皮膚發(fā)育、血液循環(huán)、能量代謝、腎臟發(fā)育、前腦神經(jīng)元調(diào)控等生理功能有關(guān)，揭示出中國南方豬和北方豬適應(yīng)不同溫度環(huán)境的分子機(jī)制，研究結(jié)果對培育適應(yīng)我國不同溫度環(huán)境的優(yōu)良豬種、促進(jìn)我國養(yǎng)豬業(yè)的可持續(xù)發(fā)展具有重要的科學(xué)價值。特別值得一提是，研究人員在X號染色體發(fā)現(xiàn)一個長達(dá)14Mb的低重組區(qū)，南北方豬在該區(qū)域存在兩種截然不同且經(jīng)歷了環(huán)境適應(yīng)性自然選擇的單倍型。令人意外的是，北方豬單倍型很可能來自另一個已經(jīng)滅絕的豬屬（Suide），該屬間雜交事件據(jù)推算發(fā)生于數(shù)十萬年前。這是首次在哺乳動物中發(fā)現(xiàn)古老屬間雜交導(dǎo)致適應(yīng)性進(jìn)化的遺傳學(xué)證據(jù)，改變了人們對哺乳動物適應(yīng)性進(jìn)化的認(rèn)識。